Système d'hémoculture simplifié (SIMBLE)

À propos
Le projet SIMBLE est désigné pour évaluer Bactinsight, notre système d'hémoculture simplifié récemment développé, qui se compose de deux modules :
Un dispositif de mesure portable (turbidimètre), qui détecte la croissance bactérienne dans les flacons d'hémoculture, sur la base de la turbidité du moyen de culture
Des flacons d'hémoculture avec une formulation optimisée
Un module supplémentaire du système Bactinsight contient un microscope sans lentille, qui simplifie et accélère l'identification des organismes responsables. Bactinsight sera évalué sur deux sites de terrain en Afrique de l'Ouest, en le comparant aux systèmes de référence déjà utilisés. En outre, nous évaluerons la facilité d'utilisation, l'acceptabilité, l'adoptabilité et la performance du système.
Les flacons d'hémoculture de Bactinsight seront produits localement au Bénin, dans une unité de production de conteneurs installée sur le campus de Cotonou au début du projet. Avec cette infrastructure de production, nous voulons renforcer la production locale non seulement pendant l'étude SIMBLE, mais aussi après.
Projet
Essai de diagnostic clinique en Afrique de l'Ouest d'un système d'hémoculture simplifié pour améliorer les soins de santé dans les milieux à faibles ressources
Période
Juillet 2021 – septembre 2025
Contact
Liselotte Hardy
Coordinateur de l'essai
✉ lhardy@itg.be

Partenaires du consortium
Liselotte Hardy – Institut de Médecine Tropicale (IMT), Belgique
Roel Baets – Université de Gand (UGent), Belgique
Olivier Vandenberg – Université Libre de Bruxelles (ULB), Belgique
Pierre Marcoux – Commissariat à l'Energie Atomique et aux Energies Alternatives (CEA), France
Marti Asensio – Reactivos Para Diagnóstico (RPD), Espagne
Dissou Affolabi – Centre National Hospitalier Universitaire de Pneumo-Phtisiologie (CNHU-PPC), Bénin
Adama Zida – Centre Hospitalier Universitaire Yalgado Ouédraogo (CHUYO), Burkina Faso

Alerte publication !
Nous sommes ravis de partager la publication des résultats in-vitro de SIMBLE pour le microscope sans lentille. Notre approche utilise un système d’imagerie simple combiné à un apprentissage automatique avancé pour identifier rapidement et précisément les bactéries en fonction des colonies qu'elles forment. Cette méthode, qui ne nécessite pas d'équipement coûteux, a été testée dans le laboratoire de l'ULB à Bruxelles sur 252 échantillons bactériens et a obtenu un taux de précision élevé de 91,7 %. Cette avancée pourrait faciliter le diagnostic des infections dans les milieux à ressources limitées, aidant ainsi les médecins à fournir des traitements plus rapides et plus efficaces. Nous avons également rendu les données et l’outil d’identification accessibles au public, encourageant ainsi la recherche et le développement dans ce domaine important. https://doi.org/10.1155/2024/6465280
Voir les publications
2024
Douarre C, David D, Fangazio M, Picard E, Hadji E, Vandenberg O, Barbé B, Hardy L, Marcoux P. Simple Imaging System for Label-Free Identification of Bacterial Pathogens in Resource-Limited Settings. Volume 2024, Article ID 6465280. https://doi.org/10.1155/2024/6465280
2023
Massou F, Gouton A O, Palomo B, Senou J-C, Porta A, Barbé B, Affolabi D, Hardy L. Laboratory-on-a-ship: a microbiology culture media production facility in a sea container for local production in low-resource settings. Lancet Microbe March 9, 2023. https://doi.org/10.1016/S2666-5247(23)00070-8
2022
Barbé B, Corsmit E, Jans J, Kaur K, Baets R, Jacobs J, Hardy L. Pilot Testing of the “Turbidimeter”, a Simple, Universal Reader Intended to Complement and Enhance Bacterial Growth Detection in Manual Blood Culture Systems in Low-Resource Settings. Diagnostics. 2022; 12(3):615. https://doi.org/10.3390/diagnostics12030615
Ombelet S, Natale A, Ronat JB, Kesteman T, Vandenberg O, Jacobs J, Hardy L. Biphasic versus monophasic manual blood culture bottles for low-resource settings: an in-vitro study. Lancet Microbe. 2022 Feb;3(2):e124-e132. doi: 10.1016/S2666-5247(21)00241-X
Ombelet S, Kpossou G, Kotchare C, Agbobli E, Sogbo F, Massou F, Lagrou K, Barbé B, Affolabi D, Jacobs J. Blood culture surveillance in a secondary care hospital in Benin: epidemiology of bloodstream infection pathogens and antimicrobial resistance. BMC Infect Dis. 2022 Feb 3;22(1):119. doi: 10.1186/s12879-022-07077-z.
Ombelet S, Natale A, Ronat JB, Vandenberg O, Jacobs J, Hardy L. Considerations in evaluating equipment-free blood culture bottles: A short protocol for use in low-resource settings. PLoS One. 2022 Apr 25;17(4):e0267491. doi: 10.1371/journal.pone.0267491. eCollection 2022.
2021
Orekan J, Barbé B, Oeng S, Ronat JB, Letchford J, Jacobs J, Affolabi D, Hardy L. Culture media for clinical bacteriology in low- and middle-income countries: challenges, best practices for preparation and recommendations for improved access. Clin Microbiol Infect. 2021 May 18:S1198-743X(21)00239-1. doi: 10.1016/j.cmi.2021.05.016.
Pierre Marcoux (CEA-LETI) and Liselotte Hardy (ITM) are co-editors of a special issue for the journal “Frontiers in Cellular and Infection Microbiology” dedicated to “Phenotypic identification of micro-organisms through label-free optic methods”
Liselotte Hardy (ITG) is editor of a special issue for the journal “Diagnostics” that is fully dedicated to “Point-of-care Diagnostics for Low-Resource Settings”
Voir les présentations orales / posters
À Knowledge for Growth, 16 mai 2024 (Anvers) :
Cornelis J, Barbé B, Ghomashi M, Corsmit E, Genbrugge E, Marchesin F, Yanlu L, Baets R, Jacobs J, Hardy L. Development of a diagnostic prototype for detecting bloodstream infections : the BactInsight turbidimeter.
Au Congrès européen de Microbiologie clinique et des Maladies infectieuses (ESCMID Global), 27-30 avril 2024 (Barcelone) :
Barbé B, Cornelis J, Ghomashi M, Corsmit E, Genbrugge E, Marchesin F, Li Y, Baets R, Jacobs J, Hardy L. The BactInsight system: a simplified blood culture system developed for resource-limited settings, performs well compared to an automated reference system in a simulated test design
A l'ASLM, 12-15 décembre 2023 (le Cap) :
Douarre C, David D, Picard E, Hadji E, Marcoux P. Diagnosis of bacterial bloodstream infections in low-resource settings: How can imaging and AI help? Invited lecture in the session “Transforming diagnostics: the role of AI, robotic technology and computer science"
Au symposium annuel de l'IEEE Photonics Benelux, 23-24 novembre 2023 (Gand) :
Cornelis J, Ghomashi M, Corsmit E, Marchesin F, Hardy L, Baets R, Li Y. Development of an optical/electronic system for rapid detection of bacterial infection.
Au Forum EDCTP, 8-10 novembre 2023 (Paris) :
Douarre C, Fangazio M, David D, Picard E, Hadji E, Vandenberg O, Hardy L, Marcoux P. Simple imaging system for optical label-free identification of bacterial clinical isolates in Low-Resource Settings (LRS). BMJ Global Health 2023;8:A48.
Barbé B, Corsmit E, Ghomashi M, Marchesin F, Cornelis J, Kaur K, Baets R, Jacobs J, Hardy L. Access to diagnosis of bloodstream infections in low-resource settings: evaluation of the improved “Turbidimeter” prototype to detect bacterial growth in manual blood culture systems. BMJ Global Health 2023;8:A75-A76.
Au Congrès européen de la microbiologie clinique et des maladies infectieuses (ECCMID), 15 au 18 avril 2023 (Copenhague) :
Massou F, Gouton A O, Palomo B, Senou J-C, Porta A, Barbé B, Affolabi D, Hardy L. Improving local production of quality-assured culture media in resource limited settings: design, manufacturing, transport, and installation of a microbiology production facility in a transportable container at Cotonou, Benin
Au Congrès européen de la microbiologie clinique et des maladies infectieuses (ECCMID), 9 au 12 juillet 2021 (en ligne) :
Barbé B, Corsmit E, Jans J, Kaur K, Baets R, Jacobs J, Hardy L. Equipment-free detection of bacterial growth in blood cultures for low-resource settings: proof of concept of the Turbidimeter.
Schiavone P, Zamoun I, Soulan S, Maire A, Gougis M, Marcoux PR, González TY, Mugnier G, Picard E, Zelsmann M, Hadji E, Peyrade D. Artificial intelligence and large field, high resolution lensless imaging for nondestructive, label-free identification directly on agar.
Marcoux PR, Fourar M, Hamerlinck H, Naessens E, Ngolè F, Benahmed S, Bergmann E, Decq D, Mermet X, Belafdil C, Gal O, Grohs P, Verhasselt B, Roch M, Schultz E. Nondestructive optical identification of pathogens on agar through laser backscattering.
Financement
Thèmes de recherche

La résistance aux antimicrobiens
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