Vereenvoudigd Bloedkweeksysteem (SIMBLE)

Over dit project
Het SIMBLE-project dient als evaluatie voor ons recent ontwikkelde vereenvoudigde bloedkweeksysteem Bactinsight, dat bestaat uit twee modules:
Een draagbaar meetapparaat (turbidimeter) dat op basis van de troebelheid van het kweekmedium de bacteriële groei in bloedkweekflessen detecteert
Bloedkweekflessen met een geoptimaliseerde formulering
Bovendien beschikt het Bactinsight-systeem over een lensvrije microscoop die de identificatie van de veroorzakende organismen vereenvoudigt en versnelt. Het bloedkweeksysteem zal op twee sites in West-Afrika worden beoordeeld en vergeleken met de reeds bestaande referentiesystemen. Bovendien zullen we het gebruiksgemak, de bruikbaarheid, de toepasbaarheid en de prestaties van het systeem evalueren.
De bloedkweekflessen van Bactinsight worden in Benin in een productiecontainers geproduceerd, die bij de start van het project op de campus van Cotonou zal worden geïnstalleerd. Met die productiefaciliteit willen we de lokale productie bekrachtigen, niet alleen tijdens de SIMBLE-studie, maar ook nadien.
Project
Klinisch-diagnostische studie in West-Afrika over een vereenvoudigd bloedkweeksysteem ter verbetering van de gezondheidszorg in gebieden met weinig middelen
Periode
Juli 2021 – september 2025
Contact
Liselotte Hardy
Coördinerend onderzoeker
✉ lhardy@itg.be

Consoriumpartners
Liselotte Hardy – Instituut voor Tropische Geneeskunde (ITG), België
Roel Baets – Universiteit Gent (UGent), België
Olivier Vandenberg – Université Libre de Bruxelles (ULB), België
Pierre Marcoux – Commissariat à l'Energie Atomique et aux Energies Alternatives (CEA), Frankrijk
Marti Asensio – Reactivos Para Diagnóstico (RPD), Spanje
Dissou Affolabi – Centre National Hospitalier Universitaire de Pneumo-Phtisiologie (CNHU-PPC), Benin
Adama Zida – Centre Hospitalier Universitaire Yalgado Ouédraogo (CHUYO), Burkina Faso

Publicatie-alert!
De eerste resultaten van de in vitro studie met de SIMBLE lensvrije microscoop werden gepubliceerd! Met de lensvrije microscoop, een eenvoudig beeldvormingssysteem in combinatie met geavanceerde machine learning, kunnen we bacteriën snel en nauwkeurig identificeren op basis van de gevormde kolonies. Deze methode, die geen dure apparatuur vereist, werd getest in het ULB-laboratorium in Brussel op 252 bacteriële monsters en behaalde een hoge nauwkeurigheid van 91,7%. Deze doorbraak zou het gemakkelijker kunnen maken om infecties te diagnosticeren in omgevingen met beperkte middelen, waardoor artsen sneller en effectiever kunnen handelen. We hebben de gegevens en het identificatie tool ook beschikbaar gesteld voor het publiek, zodat verder onderzoek en ontwikkeling in dit belangrijke vakgebied kan worden aangemoedigd. https://doi.org/10.1155/2024/6465280
Bekijk publicaties
2024
Douarre C, David D, Fangazio M, Picard E, Hadji E, Vandenberg O, Barbé B, Hardy L, Marcoux P. Simple Imaging System for Label-Free Identification of Bacterial Pathogens in Resource-Limited Settings. Volume 2024, Article ID 6465280. https://doi.org/10.1155/2024/6465280
2023
Massou F, Gouton A O, Palomo B, Senou J-C, Porta A, Barbé B, Affolabi D, Hardy L. Laboratory-on-a-ship: a microbiology culture media production facility in a sea container for local production in low-resource settings. Lancet Microbe March 9, 2023. https://doi.org/10.1016/S2666-5247(23)00070-8
2022
Barbé B, Corsmit E, Jans J, Kaur K, Baets R, Jacobs J, Hardy L. Pilot Testing of the “Turbidimeter”, a Simple, Universal Reader Intended to Complement and Enhance Bacterial Growth Detection in Manual Blood Culture Systems in Low-Resource Settings. Diagnostics. 2022; 12(3):615. https://doi.org/10.3390/diagnostics12030615
Ombelet S, Natale A, Ronat JB, Kesteman T, Vandenberg O, Jacobs J, Hardy L. Biphasic versus monophasic manual blood culture bottles for low-resource settings: an in-vitro study. Lancet Microbe. 2022 Feb;3(2):e124-e132. doi: 10.1016/S2666-5247(21)00241-X
Ombelet S, Kpossou G, Kotchare C, Agbobli E, Sogbo F, Massou F, Lagrou K, Barbé B, Affolabi D, Jacobs J. Blood culture surveillance in a secondary care hospital in Benin: epidemiology of bloodstream infection pathogens and antimicrobial resistance. BMC Infect Dis. 2022 Feb 3;22(1):119. doi: 10.1186/s12879-022-07077-z.
Ombelet S, Natale A, Ronat JB, Vandenberg O, Jacobs J, Hardy L. Considerations in evaluating equipment-free blood culture bottles: A short protocol for use in low-resource settings. PLoS One. 2022 Apr 25;17(4):e0267491. doi: 10.1371/journal.pone.0267491. eCollection 2022.
2021
Orekan J, Barbé B, Oeng S, Ronat JB, Letchford J, Jacobs J, Affolabi D, Hardy L. Culture media for clinical bacteriology in low- and middle-income countries: challenges, best practices for preparation and recommendations for improved access. Clin Microbiol Infect. 2021 May 18:S1198-743X(21)00239-1. doi: 10.1016/j.cmi.2021.05.016.
Pierre Marcoux (CEA-LETI) and Liselotte Hardy (ITM) are co-editors of a special issue for the journal “Frontiers in Cellular and Infection Microbiology” dedicated to “Phenotypic identification of micro-organisms through label-free optic methods”
Liselotte Hardy (ITG) is editor of a special issue for the journal “Diagnostics” that is fully dedicated to “Point-of-care Diagnostics for Low-Resource Settings”
Bekijk mondelinge presentaties / posterpresentaties
Op Knowledge for Growth, 16 mei 2024 (Antwerpen):
Cornelis J, Barbé B, Ghomashi M, Corsmit E, Genbrugge E, Marchesin F, Yanlu L, Baets R, Jacobs J, Hardy L. Development of a diagnostic prototype for detecting bloodstream infections: the BactInsight turbidimeter.
Op het Europees Congres voor Klinische Microbiologie en Infectieziekten (ESCMID Global), 27-30 april 2024 (Barcelona):
Barbé B, Cornelis J, Ghomashi M, Corsmit E, Genbrugge E, Marchesin F, Li Y, Baets R, Jacobs J, Hardy L. The BactInsight system: a simplified blood culture system developed for resource-limited settings, performs well compared to an automated reference system in a simulated test design
Op het ASLM, 12-15 december 2023 (Kaapstad):
Douarre C, David D, Picard E, Hadji E, Marcoux P. Diagnosis of bacterial bloodstream infections in low-resource settings: How can imaging and AI help? Invited lecture in the session “Transforming diagnostics: the role of AI, robotic technology and computer science"
Op het jaarlijkse IEEE Photonics Benelux Symposium, 23-24 november 2023 (Gent):
Cornelis J, Ghomashi M, Corsmit E, Marchesin F, Hardy L, Baets R, Li Y. Development of an optical/electronic system for rapid detection of bacterial infection.
Op het EDCTP-forum, 8-10 november 2023 (Parijs):
Douarre C, Fangazio M, David D, Picard E, Hadji E, Vandenberg O, Hardy L, Marcoux P. Simple imaging system for optical label-free identification of bacterial clinical isolates in Low-Resource Settings (LRS). BMJ Global Health 2023;8:A48.
Barbé B, Corsmit E, Ghomashi M, Marchesin F, Cornelis J, Kaur K, Baets R, Jacobs J, Hardy L. Access to diagnosis of bloodstream infections in low-resource settings: evaluation of the improved “Turbidimeter” prototype to detect bacterial growth in manual blood culture systems. BMJ Global Health 2023;8:A75-A76.
Op het Europese congres over klinische microbiologie en infectieziekten (ECCMID), 15 tot 18 april 2023 (Kopenhagen):
Massou F, Gouton A O, Palomo B, Senou J-C, Porta A, Barbé B, Affolabi D, Hardy L. Improving local production of quality-assured culture media in resource limited settings: design, manufacturing, transport, and installation of a microbiology production facility in a transportable container at Cotonou, Benin
Op het Europese congres over klinische microbiologie en infectieziekten (ECCMID), 9 tot 12 juli 2021 (online):
Barbé B, Corsmit E, Jans J, Kaur K, Baets R, Jacobs J, Hardy L. Equipment-free detection of bacterial growth in blood cultures for low-resource settings: proof of concept of the Turbidimeter.
Schiavone P, Zamoun I, Soulan S, Maire A, Gougis M, Marcoux PR, González TY, Mugnier G, Picard E, Zelsmann M, Hadji E, Peyrade D. Artificial intelligence and large field, high resolution lensless imaging for nondestructive, label-free identification directly on agar.
Marcoux PR, Fourar M, Hamerlinck H, Naessens E, Ngolè F, Benahmed S, Bergmann E, Decq D, Mermet X, Belafdil C, Gal O, Grohs P, Verhasselt B, Roch M, Schultz E. Nondestructive optical identification of pathogens on agar through laser backscattering.
Funding
Onderzoeksthema's

Antimicrobiële resistentie
Lees meerDeel project op